Ретровиральной ДНК требуется время, чтобы найти его дом, но вставка происходит моментально

Новое исследование во главе с исследователями в Университете штата Огайо Всесторонний Онкологический центр – онкологическая больница Артура Г. Джеймса и Научно-исследовательский институт Ричарда Дж. Солоува (OSUCCC – Джеймс) показывают детали о том, как такие вирусные комплексы вставки ДНК охотятся для подходящего места и как быстро вставка происходит на выбранном месте.

Результаты могли помочь улучшить лечение ВИЧ-инфекции и сделать генотерапию более безопасной и более эффективной.Исследователи использовали Прототип Пенистый Вирус integrase как модель и два молекулярных метода микроскопии, чтобы сделать запись вирусных комплексов интеграции, едущих вдоль отрезков целевой ДНК в поисках точек вставки. (Комплексы интеграции состоят из вирусной ДНК плюс ферменты, которые вставляют ее в ДНК хозяина.)Комплексы интеграции прошли целевая ДНК для расстояний 1 500 пар оснований ДНК в течение периодов 2-3 секунд.

Когда они нашли сладкое место, вставка вирусной ДНК произошла меньше чем за половину секунды – 0,470 секунды, чтобы быть точной.Исследование опубликовано в журнале Nature Communications.«Мы были удивлены, что комплекс фермента делает такой поиск», говорит co-corresponding автор Кристин Йодер, доктор философии, доцент молекулярной вирусологии, иммунологии и медицинской генетики.«Поиск 1.5 kilobases ДНК является настоящим расстоянием, и 2-3 секунды – долгое время в молекулярных терминах, чтобы остаться связанными с ДНК».

Их данные также показали, что вирусные комплексы интеграции проходят ДНК как орех на болте вместо того, чтобы двигать вдоль подобного моечную машину.Результаты важны, объясняет Йодер. «Интеграция ретровиральной ДНК – относительно необычное событие по сравнению с количеством вирусных копий ДНК, найденных в инфицированных клетках. Если мы можем понять, почему вставка не происходит чаще, она могла бы привести к новым наркотикам, которые предотвращают ретровиральную инфекцию.

«Наше исследование предполагает, что проблема заключается в поиске места вставки а не самой вставки», говорит она. «Кроме того, генотерапия включает поиск и события вставки, таким образом, наши результаты могли бы помочь сделать тот процесс более эффективным».


Блог Фенома