Меланома – самая смертоносная форма рака кожи, по оценкам Национального института рака, от которой ежегодно страдают более 70000 человек в США, и уровень заболеваемости продолжает расти. В исследовании, опубликованном в Интернете в Genome Research, исследователи определили ранее неизвестную некодирующую РНК, которая играет важную роль в биологии меланомы, и это открытие может привести к новой цели для терапии.
Большинство видов рака кожи – это немеланомы, возникающие из других клеток, а не меланоцитов (клеток, продуцирующих меланин, которые отвечают за загар). Меланомы, рак кожи, возникающий из меланоцитов, встречаются реже, но более опасны, потому что они могут мигрировать глубоко в кожу, чтобы найти кровеносные и лимфатические сосуды, которые помогают опухолевым клеткам расти и распространяться на другие части тела.
Онкогены – это гены, которые потенциально могут вызывать рак и часто мутируют в опухолевых клетках, включая меланомы. Мутации онкогена BRAF присутствуют более чем в 70% меланом, и подавляющее большинство мутантов BRAF представляют собой единственную мутантную форму BRAFV600E. Ингибиторы BRAFV600E, используемые в клинике, могут вызывать регрессию опухоли, но в конечном итоге у пациентов возникает рецидив.
Чтобы лучше понять биологию онкогенного BRAF и определить новые мишени для терапии, исследователи изучают мир РНК рака. РНК – это молекулы-мессенджеры, которые клетка в основном использует для передачи информации, хранящейся в последовательности ДНК, и преобразования ее в функциональные белки. Однако около 50% транскрибируемых РНК на самом деле вообще не кодируют белки, но многие РНК могут по-прежнему играть важную регуляторную роль.
В этом отчете группа исследователей во главе с доктором. Росс Флокхарт и Пол Хавари из медицинского факультета Стэнфордского университета исследовали мир РНК меланомы BRAFV600E путем секвенирования и анализа РНК "транскриптом" образцов пациентов. Они искали транскрипты РНК, в том числе те, которые, возможно, никогда не были охарактеризованы ранее, которые перепрограммированы BRAFV600E и могут иметь отношение к меланоме.
"Копнув глубже, чем когда-либо прежде, мы обнаружили более 100 генов, кодирующих длинные некодирующие РНК, которые сильно изменены BRAFV600E," сказал Флокхарт. Длинные некодирующие РНК (днРНК) вызывают значительный интерес, поскольку эти молекулы участвуют в различных клеточных функциях, но роль днРНК при раке не совсем понятна. Из днРНК, измененных BRAFV600E, Флокхарт и его коллеги сосредоточились на ранее не охарактеризованном гене днРНК, который периодически и сильно индуцируется при меланомах, называемом BANCR. "Повышенная активация нового гена, который мы обнаружили, не кажется изолированным событием," Флокхарт отметил. "Будет интересно выяснить, так ли это и при других формах рака."
Чтобы проверить, какую роль BANCR может играть в меланоме, команда обнаружила, что отключение BANCR в раковой клетке методом нокдауна снижает способность клеток меланомы мигрировать в эксперименте на культуре клеток. Это указывает на то, что BANCR необходим для полной миграционной способности при меланоме и может быть потенциальной мишенью для терапии.
Авторы объяснили, что их работа иллюстрирует возможности секвенирования РНК для изучения рака, такого как меланома, и выявления ранее неизвестного регулятора прогрессирования заболевания. Поскольку такие исследования, как это, рисуют более полную картину биологии рака, мы будем лучше понимать, как опухоли ускользают от лекарств и как ранее неизвестные игроки, такие как BANCR, могут стать новыми мишенями для лечения.