Новое изучение говорит о том, что целое упорядочивание генома может скоро и совершенно верно дифференцироваться среди штаммов устойчивого к метицилину золотистого стафилококка(MRSA) в методе, которым не смогут текущие способы лаборатории. Ускорение благоприятного поворота таковой ответственной информации может оказать помощь руководить стационарными вспышками супервируса, сообщилисследователи.
Исследователи упорядочили геномы образцов MRSA от настоящей стационарной вспышки и нашли, что они имели возможность совершенно верно отличить штаммы, каковые были частьювспышка от штаммов, каковые не были, стремительнее, чем простые клинические способы тестирования. Они предлагают, имел сделанный, это, быть может, помогло инфекционному контролюи лечение больных и сокращенный длительность вспышки, случившейся в новорожденной палате интенсивной терапии.Исследователи из института Wellcome Trust Sanger, Кембриджского университета в Англии, и Illumina, интернациональной компании, что секвенсеры ДНК рынков, пишутоб их итогах изучения в сетевой проблеме 14 июня The New England Journal of Medicine, NEJM.Ведущими авторами есть врач Шарон Пикок, учитель в Патологии и Медицинских факультетах в Кембриджском университете, враче Джеффри Смите старшем
Директор по изучениям в Illumina и врач Джулиан Пархилл, от университета Wellcome Trust Sanger.Пархилл сообщил прессу:«Различение [MRSA] штаммы принципиально важно для управления инфекционным контролем».«Стремительное воздействие принципиально важно, дабы руководить подозреваемой вспышкой, но оно имеет равное значение, дабы идентифицировать несвязанные штаммы, дабы не допустить ненужные закрытия палаты идругие подрывные меры контроля. Потребность здравоохранения лучше, более действенные методы идентифицировать вспышку и после этого обрабатывает эти», растолковал он.
Пикок заявил, что «ответственное ограничение текущей методике инфекционного контроля – то, что дешёвые бактериальные способы типирования не смогут различать разныйштаммы MRSA."Она заявила, что команда желала определить, имело возможность ли бы целое упорядочивание генома MRSA сообщить разные штаммы обособленно на уровне генома, и в случае если эта информация имела возможностьбудьте услужливы в управлении расследования вспышки.Команда решила изучить недавнюю вспышку, уже законченную, и работа над темпом, что будет быть похожим работу в «настоящее время» на протяжениивспышка, случившаяся в неонатальном отделении поликлиники.
«При помощи стремительной разработке упорядочивания высокой пропускной свойстве с клинически соответствующим сроком исполнения работы мы ретроспективно упорядочили ДНК от семь, выделяетсвязанный со вспышкой и еще семью MRSA выделяет связанный с носительством MRSA либо бактериемии в той же поликлинике», пишут они.Методом сравнения последовательностей ДНК (полиморфизмы единственного нуклеотида, SNPs) по большей части геноме к справочному геному, они произвели эволюционное дерево этопродемонстрированный «разная несколько вспышки выделяет и ясное разделение между ними, и невспышка выделяет».Команда кроме этого собрала «resistome», по существу перечень всех генов MRSA та устойчивость к антибиотикам обстоятельства.
Таковой инструмент обязан оказать помощь здоровьюспециалисты скоро идентифицируют устойчивость к лекарству в штаммах MRSA, так, отдельные больные смогут пройти самоё соответствующее лечение. Это может кроме этого оказать помощь найти новыймеханизмы устойчивости к лекарству.
Они кроме этого создали «toxome» генов токсина, каковые смогут скоро идентифицировать присутствующих в штаммах MRSA. На данный момент они смогут лишь быть отысканы с кратным числомпробы в справочных лабораториях.
MRSA создаёт неповторимые токсины, каковые смогут привести к тяжёлым болезням как септический шок, пневмония, и осложненная мягкая ткань и кожаинфекции.В их заключении пишет команда:«Упорядочивание целого генома может обеспечить клинически соответствующие данные в течение периода времени, что может оказывать влияние на контроль за больным. Потребность в автоматизированной интерпретации данныхи положение клинически значащих отчетов воображает препятствия клиническому внедрению."
Смит заявил, что изучение показывает, «как удачи в целом упорядочивании генома смогут дать значительную данные, дабы оказать помощь бороться со стационарными вспышками в клиническисоответствующие оборотные времена."Упорядочивающие способы продвинулись так скоро и стали такими точными и всесторонними, они смогут ответить на последовательность вопросов, каковые серьёзны дляконтроль внутрибольничных зараз.«Не только имел возможность мы отличать разные штаммы MRSA в поликлинике, мы кроме этого смогли скоро характеризовать устойчивость к антибиотикам и гены токсина, существующие вклиническое выделяет», сообщил Смит.
Пархилл добавил:«Текущие клинические способы, дабы вынудить связи между связанными штаммами сравнить структуру бактериальной чувствительности к профилю антибиотиков. Мы нашли данный способ кбудьте неточны. Мы идентифицировали два штамма MRSA, каковые, казалось, были аналогичными применяющими текущими способами, генетически весьма отличались."Исследователи предлагают, дабы целое упорядочивание генома в один раз было простой изюминкой здравоохранения, и это изучение показывает, как применение его в реальном времени имело возможность сделать aбольшая отличие для контроля MRSA и других вспышек в стационарных параметрах настройки.
Пикок заявил, что следующий ход обязан сделать интерактивные инструменты, разрешающие медицинским работникам трактовать последовательности генома машинально. Лишь тогда может способ бытьвыкаченный для применения в клиниках.Зараза MRSA есть основной проблемой здравоохранения. Кроме того в то время, когда это удачно лечится, это может удвоиться, средние больные времени остаются в возрастающей поликлинике,затраты на здравоохранение.
В Соединенных Штатах оценки на 2008 предполагают, что в том году было более чем 89 500 инвазивных зараз MRSA, и более чем 15 200 смертельных случаев были связаны ссупервирус.