Ученые из Института Иммунологии Университетского Медицинского центра Университета Йоханнеса Гутенберга Майнц (JGU) теперь значительно улучшили этот аналитический метод, который широко используется в их области. Они также разработали программу для интегрированного анализа данных об измерении под названием ISOQuant. Их оптимизированный массовый спектральный технологический процесс позволяет определять и определять количество значительно большего количества белков, чем прежде. Разработка этого расширенного метода измерения и специально разработанного программного обеспечения описана в статье, недавно опубликованной в журнале Nature Methods.
Протеом представляет весь набор белков, выраженных клеткой. Посредством анализа протеомов таким образом возможно получить всестороннюю картину белков и пептидов, существующих в клетках или биологических жидкостях. Однако многие традиционные массовые спектральные методы, используемые до настоящего времени для протеомного анализа, относительно медленные и не всегда обеспечивают восстанавливаемые результаты.
Доктор Стефан Тензер из Института Иммунологии и его коллег усовершенствовал относительно новую, независимую от данных технику, которая облегчает очень точный и восстанавливаемый количественный анализ. С его помощью еще много белков могут быть определены, чем прежде. «Фигурально говоря, оборудование, которое мы используем, так же точно как масштаб, который может сказать, присутствует ли монета за два евро в VW Beetle или не», объясняет Тензер.Рабочая группа Тензера сосредотачивается в особенности на развитии новых методов для количественного протеомного анализа при помощи так называемой масс-спектрометрии подвижности иона. Эта техника позволяет не только измерять массу молекулы, но и может также, чтобы определить ее поперечное сечение.
Это дополнительное аналитическое измерение отдает технику, которой оптимально удовлетворяют для всестороннего расследования очень сложных образцов. Тензеру и его коллегам также удалось увеличить технику, известную как определение количества без этикеток.
Это избавляет от необходимости образцы быть маркированной в лаборатории прежде чем быть проанализированным, в других отношениях сложная процедура. «Мы теперь в состоянии непосредственно проанализировать терпеливые образцы и определенные иммуноциты без предшествующей дорогостоящей подготовки», говорит Тензер. Находящиеся в Майнце ученые определенно разработали свою программу ISOQuant с этой целью.
Это предусматривает стандартизированный анализ сложного материала данных и обычно упрощает метод количественного массового спектрального анализа.Эти инновационные инновации были развиты под эгидой технологических платформ «Количественный Протеомный Анализ» Иммунологии Научно-исследовательского центра JGU (FZI) и «ProTIC» Единицы Исследования Переводные Нейронауки (FTN) в Университетском Медицинском центре Майнца. Они были теперь изданы по своей природе Методы. Это уже было третьей статьей, опубликованной в группе журнала Nature в 2013 доктором Стефаном Тензером и его коллегами.
«Годы работы в технологической платформе окупились с точки зрения кванта, прыгают вперед относительно улучшения метода протеомной аналитической масс-спектрометрии», заявил профессор Хэнсджорг Шильд, директор Института Иммунологии и Координатор Иммунологии Научно-исследовательского центра (FZI) в Университетском Медицинском центре Майнца. «Результаты, полученные доктором Стефаном Тензером и его коллегами, отражают качество достижения этой команды. Я думаю, что мы можем с нетерпением ждать нового и захватывающего сотрудничества в будущем», сказал Шильд.
«Масс-спектрометрия – техника, которая теперь стала обязательной в области нейронаук. В этой области нам определенно нужны очень чувствительные аналитические методы, и доктор Тензер открыл новые перспективы в этом отношении», подчеркнул профессор Роберт Нич, Координатор Единицы Исследования Переводные Нейронауки и Совместного Научно-исследовательского центра 1080 на «Молекулярных и Клеточных Механизмах Нейронного Гомеостаза» в Университетском Медицинском центре Майнца. «Сотрудничество между Иммунологией Научно-исследовательского центра и Единицей Исследования, Переводные Нейронауки в области масс-спектрометрии представляют прекрасную возможность для нас получить новое понимание пути функции мозга», требовал Нич.