Онлайн-конкурс, проводимый совместно с онлайн-платформой Kaggle, клиникой Мэйо, Пенсильванский университет, позволит самым увлеченным специалистам в области данных потерять священный Грааль исследований эпилепсии – алгоритм, который может предсказывать приступы, – используя данные пациентов, которые никогда ранее не были доступны. исследователям.
Университет Мельбурна объединяет усилия с американской платформой аналитики и прогнозного моделирования Kaggle, получившей название онлайн "стадион" науки о данных – в партнерстве с Пенсильванским университетом и клиникой Мэйо для поиска решения.
Профессор Мельбурнского университета Марк Кук, специалист по эпилепсии и клиницист, сказал, что ожидает, что сотни команд по всему миру возьмутся за решение этой задачи.
"Будущее нейробиологии все чаще заключается в привлечении самых умных людей из нескольких дисциплин, где бы мы их ни находили," Профессор Кук сказал.
"Мы собираемся стать свидетелями захватывающего сближения инженерии и неврологии для решения одной из самых сложных загадок медицинской науки."
Команды будут обрабатывать данные о мозговых волнах человека за период от шести месяцев до трех лет. До сих пор международные исследователи могли работать только с данными, полученными в течение двух недель.
Профессор инженерии Дэвид Грейден, который является частью команды, разрабатывающей устройство Stentrode, которую похвалил президент США Барак Обама, сказал, что данные были получены с помощью имплантируемого устройства, разработанного стартапом NeuroVista из Сиэтла. В Мельбурнском университете прошли единственные в мире клинические испытания устройства.
"До сих пор у исследователей было только двухнедельное окно для извлечения данных о мозговых волнах с электродов, когда люди с эпилепсией попадают в больницу," он сказал.
"Обычно это позволяет получить доступ к данным до 10 захватов. Теперь мы можем предложить данные о десятках изъятий, измеренных за более длительный период.
"Это единственный набор данных с достаточным объемом данных для точной оценки алгоритмов прогнозирования приступов у людей."
Ведущий организатор, старший инженер-исследователь Левин Кульман, сказал, что конкурс Kaggle 2014 года, проведенный UPenn и Mayo, предлагал данные, полученные от людей, за две недели, и более долгосрочные данные, полученные от собак.
"Этот конкурс выявил некоторые новые и существующие подходы, которые показали себя хорошо, и теперь мы хотим знать, насколько хорошо в этом конкурсе они могут работать с долгосрочными данными, полученными от людей," он сказал.
Участники будут бороться за призовой фонд до 20 000 долларов США. У команд будет чуть менее трех месяцев, чтобы изучить более 60 ГБ данных с интервалами как до, так и между приступами.
Победители поделятся своими алгоритмами онлайн через Kaggle, а результаты будут представлены на следующем ежегодном собрании Американского общества эпилепсии в декабре.
Конкурс проводится университетом совместно с Американским обществом эпилепсии, Национальным институтом здравоохранения и американской фирмой по разработке программного обеспечения MathWorks, которая разработала инструмент, который будет предложен участникам конкурса.
Д-р Кульманн сказал, что конкурс предоставит командам доступ к самому ценному в мире набору данных в исследованиях по прогнозированию изъятий.
"Конечная цель игры – предупредить пациентов о надвигающемся припадке или активировать имплантируемое устройство, которое останавливает припадки," Д-р Кульман сказал.
Это поможет снять стресс, вызванный незнанием того, когда случится припадок, и значительно улучшит качество жизни людей с эпилепсией."