Исследователи обнаружили важное генетическое свидетельство, подтверждающее роль группы генов, борющихся с вирусами, в развитии рака.
Наше понимание биологических процессов, вызывающих рак, ограничено. Ультрафиолетовое излучение и курение – два хорошо изученных процесса, вызывающих рак. Воздействие любого из этих процессов вызывает различимые закономерности генетического повреждения или “ сигнатуры ” генома, которые могут привести к раку. Все процессы, вызывающие рак, оставляют свой собственный отпечаток или подпись в геномах раковых клеток.
Семейство генов APOBEC контролирует ферменты, которые, как полагают, эволюционировали у людей для борьбы с вирусными инфекциями. Ученые предположили, что эти ферменты ответственны за очень четкую сигнатуру мутаций, которая присутствует примерно в половине всех типов рака. Следовательно, понимание вызывающего рак процесса, лежащего в основе этой общей генетической сигнатуры, имеет решающее значение для контроля и профилактики заболеваний.
Команда изучила геномы рака груди у пациентов со специфической наследственной делецией в двух из этих генов APOBEC. Они обнаружили, что в геномах этих раковых опухолей гораздо больше преобладают отчетливые мутационные сигнатуры, которые, как считается, обусловлены семейством генов APOBEC.
Генетическая делеция APOBEC3A-APOBEC3B связана с повышенным бременем предполагаемых сигнатур, связанных с APOBEC.Гены APOBEC3A и APOBEC3B расположены тандемно на хромосоме 22. [DOI: 10.1038 / нг.2955]
"Повышенная частота этой общей сигнатуры рака у пациентов с раком груди с аномалиями гена APOBEC подтверждает нашу теорию о том, что эти ферменты играют роль в генерации этой мутационной сигнатуры," говорит доктор Серена Ник-Зайнал, первый автор из Wellcome Trust Sanger Institute.
Эта генетическая делеция обнаружена на хромосоме 22, где гены APOBEC, APOBEC3A и APOBEC3B, расположены рядом друг с другом. Ранее сообщалось, что женщины с этой генетической делецией более восприимчивы к раку груди.
Команда исследовала 923 образца рака груди у женщин со всего мира и обнаружила более 140 человек с одной или двумя копиями делеции на каждой хромосоме. Рак груди у женщин с делецией имел гораздо большее количество мутаций именно этой генетической сигнатуры.
Однако мутационная активность генов APOBEC кажется палкой о двух концах. Эта генетическая делеция гораздо более распространена в одних популяциях, чем в других: она встречается только у 8 процентов европейцев, но присутствует у 93 процентов населения Океании. Хотя эта делеция увеличивает риск развития рака, она также дает неизвестное в настоящее время преимущество в популяциях, где она более распространена.
"В дополнение к этому процессу, опосредованному APOBEC, по-видимому, существует еще много других мутационных процессов, вызывающих рак, основная природа которых еще не выяснена," говорит профессор сэр Майк Страттон, ведущий автор и директор Института Сэнгера. "Выяснение того, что это за мутационные процессы, в будущем окажет огромное влияние на то, как мы предотвращаем и лечим рак."