Полногеномное секвенирование кода ДНК трех пренатальных образцов позволило получить подробную карту местоположения их хромосомных аномалий за 14 дней, сообщили сегодня ученые на встрече Американского общества генетики человека (ASHG) в 2012 году в Сан-Франциско.
"Такой относительно короткий период времени позволит врачам предсказать диагноз серьезных врожденных заболеваний пренатально, проконсультировать родителей и спланировать перинатальный уход за младенцами с хромосомными перестройками," сказал Зехра Ордулу, М.D., Научный сотрудник больницы Brigham and Women’s Hospital и Гарвардской медицинской школы в области акушерства, гинекологии и репродуктивной биологии, представивший исследование.
В исследовании было использовано полногеномное секвенирование после современных методов пренатальной диагностики кариотипирования и сравнительной геномной гибридизации (aCGH) для обеспечения точности уровня нуклеотидов.
Кариотипирование и исследования aCGH пренатальных образцов предоставили первые ключи к разгадке "сбалансированные de novo хромосомные перестройки," и побудили к исследованию путем геномного секвенирования.
Клинические последствия таких хромосомных перестроек, которые определяются как перемещение сегментов хромосом без какой-либо потери или увеличения геномного материала, редки, не наследуются и их сложно предсказать, не зная точных точек разрыва.
"В отличие от кариотипирования, aCGH и других стандартных методов, полногеномное секвенирование предоставило информацию для обнаружения контрольных точек" в хромосомах, в которых произошли перестройки, и тем самым определить измененные участки генома," сказала Синтия С. Мортон, доктор философии.D., Уильям Ламберт Ричардсон, профессор акушерства, гинекологии и репродуктивной биологии, профессор патологии в Бригаме и женской больнице и Гарвардской медицинской школе, а также будущий избранный президент ASHG.
"Раннее выявление генетического заболевания имеет большое значение для информирования генетического консультирования и ведения беременности, родов и дальнейшего клинического наблюдения," сказал доктор. Мортон, возглавлявший исследование.
"Это исследование предсказывает расширенную среду пренатальной диагностики, в которой секвенирование ДНК становится стандартом лечения," она добавила.
Доктор. Ордулу также добавил, "Секвенирование всего генома нового поколения в пренатальной диагностике хромосомных перестроек предлагает беспрецедентный тест с высоким разрешением для диагностики и лечения генетических нарушений."
Используя полногеномное секвенирование, Drs. Morton, Ordulu и соавторы определили в пренатальной выборке в третьем триместре первого случая, что CHD7, причинный ген синдрома CHARGE, был нарушен.
"Секвенирование всего генома соответствовало диагнозу синдрома ЗАРЯДА, что было невозможно на основании пренатальной визуализации и других широко используемых методов пренатального генетического тестирования. Этот диагноз изменил бы медицинскую помощь от первоначального плана восстановления изолированного порока сердца к лечению патологического состояния, требующего немедленной оценки затруднений с дыханием и кормлением," сказал доктор. Ордулу.
Во второй и третьей беременностях секвенирование выявило единственный нарушенный ген. "Секвенирование всего генома убедило родителей в том, что известный геномный синдром не связан с единственным поврежденным геном, и предоставило ценную дополнительную информацию для исторической оценки риска неблагоприятного исхода," Доктор. Ордулу сказал.